Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Nicotiana tabacum var. TN90) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Nicotiana tabacum

CDS Sequence

CDS ID	lcl\|NW_015929465.1_cds_XP_016476738.1_68537
CDS Infomation	[gene=LOC107798281] [db_xref=GeneID:107798281] [protein=thyroid adenoma-associated protein homolog] [protein_id=XP_016476738.1] [location=complement(join(480..2895,4411..5007,6575..6834,8526..11813))] [gbkey=CDS]
Sequence	ATGTCAGCTAAATGGAGAGCCTTACAGCATCGTCATCGTTACACTTACAGTGCCGTAATA TTTCCCAAAAATTTCAGTGACGCATTTCATCAAACACCTTCCACTCGCTTCTACACCGAA CTCAAACAATTCACCTCCTTATCATCCACATACTCTCAGCTCACTCACGCTAAAAACCTC GCTTCAGCTTTCGCCGAATTACTCTTAAACCCCAATGCTGACGTGTCATCAATATCTACA GCTTCCAGATTTTACCTAGAAATTCTCTTTCTAGAAAATTCACAGCCATTGCATAGAACT TTACTCACCGTGCTTGTCAAATGCAAGAATTTTCATAACTTAATTCGAAACTGTTTTCGT GAACTTTGCGAAGAATATGGCGAAAAAGGAAAGAGATTTTGTGTTTCTAGAGCAGCGTTG TCTATGATGAGCACACCAAAATTAGGGTACTTAGTTGAAATTGTTGAAGAATGTGGGGTT TTGGTTAGTTTAAATGTTGTATTAGGGTTAAGCGAGGTATTAGAAGAGCTGAAGAATTAT TCTAGACCGTCACCTATCGTAATGGAACAATGCAATGAAGCACTTTCGTGTATGTATTAC TTGCTTCAACGATTTCCTTTGAAGTTTGTTAATGCTGCAGGTGATAATTGTGTTTTTCTG GAGAGAATTTTGATTACTGTTTTGAGTATTTTGAGATCAGAATCATTTTCTAGGGATTGT TTAGTGGCTGCAGGGGTGAGTTTTTGCGCAGCGTTACAGGTTTGTCTTAGTCATCAAGAG CTTGGATTGTTTATTATGGAAGGAATTTTTAATGAGAGTGAAATTGTGTATGATGAGTTT GAATTTAAGGATGTAGTTAATAAAATCCCGTTTAAGGGCGATTTGATTGGTGAATTAAGT AAGTTTTTGTCGTTGAGCAGACTTTGTTTGATTCGAGGTATTTTAACTGCAGTCTCGAGG ATAGTATTGAATATTGGGTTTCTTATATCAAATGATAACGAGGAATCAATCAAGATGATT CTTTATGATGGGATTTTGCCTGAGCTTTGTAATTTTTGTGAGAATCCAATTGACAGTCAC TTCAATTTTCATGCTCTGACTGTGATGCAGATTTGCCTGCAGCAGGTTAAAACGTCGATG TTAGATAAGAATGGAAGTCGTGAAATAAATTATGATCCCATTTCTGAGGACATTGGGACA CGGTTGTTGCAAATAGTGTGGAATAATTTGGAAGATCCTCTGAGCCAAACGGTCAAACAA GTGCATCTTATTTTTGATCTCTTCTTAGACATTCAGGCTAGTCTGCACTGGGTAGAGGGT AGTGATACATTCAAATTGTTTATGAGGAAGGTTGCTTTTGATCTTCTTCGGCTGGGACCA CGTTGTAAAGGAAGATACGTTCCTTTAGCATCCCTTATCAAGAGGCTGGGCGCAAGGACA CTTTTAAGTATGAGACCAGATCTGTTGTTTGAAACGATAAAGGCATACATTGATGATGAC GTGTGCTGTGCTTTAACAACATTCCTCAAGTGTTTCCTTGAGTGTTTGCGTGATGAGTAT TGGAGTAGTGATGGTGTTGAAAGTGGGTACAACAAATATAGAGGTCATTGCCTGCCTCCA CTTTTGTCTGGCCTAGTTTCTGGACATTCAAAACTCCGCTCAAATCTTAACACCTATGCA TTGCCAGTAGTTCTTGAACTGGATGTTGATGCTATATTTCCTATGCTTGCTTTTATTGGC ATTGGATGTGGCGGGGACAATGGTGAAGTATTTCTTACTGAGCTGGATTTTAGGGGTGTG ACTCCTGCGCTTGAAGAGCGCGTGGCTGTTTTAGTTTCATTGTTTAAGGTTTCTCGTTTA CTTGCTTTGCTGGAAGGGGATATTGATTGGTCTAATAATTCTTTGTCATCCACGGAGGAC ATGGAGCTGAACTTGGAAAATAGAGATGCTGTTGCCTGCATTAAGGGGATTGAGGTTAAA GTCCCAGTGAAATATCTGGTTTTGGCACTTACCCATATTGATGAGTCGCTTCGGATTGAT GCAGCAGAATCTCTGTTCGTAAATCCAAAGACCGCAAGTTTACCATCGTCATTGGAACTC AGTCTGATGAAGGTAGCAGTTCCTTTGAACATGAGATGTTGCTCAACTGCTTTCCAGATG AAGTGGACAAGCTTATTTAGGAAGTTCTTTTCCCGGGTTCGAACAGCATTGGAGAGGCAG GTTAAGCAGGGAGGTTGGCAACCCCTTGCACATAAAGACACAAGGAGAAATTTTGTTGCC AAAGGAACAGGGGATATGTTTGAAGACAGGGCAGATGAACTTTTTAACTTTATGAAGTGG TTGGGTTGCTTTCTGTTCTTTTCGTGCTACCCATCTGCTCCATATGAGAGAAAGACAATG GCAATGGAGCTTTTATTGATAATGCTAAATGTTTGGTCTATTGTTCTTTCAAAAGAAGGA AACATTGATGCTGTTTCTCCTCAATTCTGTCTTTATCCCTACAATAAGGGGCTTCTTTTA CCTGAATCAACTCTGTTGCTGGTTGGATCAATTGTTGATAGTTGGGACCGACTTAGAGAG AGTTCTTTTCGTATTCTGCTGCATTTTCCTACCCCTCTTCCTGGAATTGATAGCCAGGAC AGGGTTAGTGAAGCAATTGTTTGGGCTAAGAAGCTAGTCTGTAGTCCACGTGTCAGAGAG AGTGATGCTGGAGCTTTGACCTTACGACTTATATTCAGAAAGTATGTTTTGGATCTTGGT TGGGTTGTTAATGCCTCATCTAACGATGTCTCTCCACAACCACTGTTGAAGCTGCTAAAT GGGGAGAATAAGGCTTGTAAGTTTGCACCTCCAGCAATAGAGTATTTAAGATCACTGATT GATTGGTTGGATGCGGTTGTTCAGGTTGGAGAGAAGGATCTCTCAGAAGCATGTAGGGGC AGCTTTGTTCATGGTGCTTTGCTTGCTCTTCGATATACTTTTGAGGAACTGGACTGGGAT TCGGATGCAGTAGTCTGCAGTATATCCGAAATGAAAGTGGTATTGGAGAAGATATTGGAG TTGGTCATGCGGATAACTTCATTGGCCCTTTGGGTGGTATCTGCTGATGCTTGGTACTTA CCTGATGATATGGAGGAAATGGATGATGATGCTCTTTTGTTAGAGGTTCCTCATGAGATG GCTGAGTCCCTATCTACCTCAGACAAGGTAGAAAATACAAAAGTGGTGCGGGATGGCAGG CAAACTGAGCAGATAGTTATGGTTGGTTGTTGGCTTGCTATGAAAGAGGTGAGCCTTCTT TTGGGAACAATAATAAGAAAGGTTCCTTTACCTACTTCAGATGTTTCTGAATCAGGTTTT CAAGCTGTTCATGAAACTGATTTATCCAATATGACGTCCGGCGCAATGCTTGATCTGAAA CAACTCGAGGTAATTGGCAACCACTTCTTGGAAGTCCTTTTGAAAATGAAGCATAATGGT GCTATTGATAAGACAAGGGCTGGATTTACTGCTCTTTGCAATCGATTACTTTGTTCGAAT GATTCAAGACTTTGTAAGTTGACTGAGTCTTGGATGGAGCAACTTATGGAACGAACAGTA GCCAAGGGACAAACAGTGGATGATCTCCTAAGGAGAAGTGCTGGTATTCCTGCAGCATTT ATTGCTTTCTTCCTTTCAGAGCCGCAGGGCACACCAAAAAGGCTTTTGCCTAGGGCATTA CGATGGTTAATAGATGTTGCTAATAAGTCTTTAACAGATCATACTGAAACAAACAGTTTC AGTGCTGATGCCTGCAATGGTTTTGTGGAGGCAAAATGTCCAGCTAATTTTTCTGAAGTT GCCCCTGATATATATGATGCTGAAAGGATTTCGAAGATTCGAGATGAGGGTGTTGTTCCT ACTGTGCATGCTTTCAATGTCCTTAAAGTTGCTTTTAATGATACCAACCTAGCAACTGAT ACATCGGGTTTTTCTGCTGAGGCTTTGATTATCTCGATACGGTGTTTCTCTTCTCCACAC TGGGAGATACGGAACAGTGCCTGTCTTGCTTATACTGCTTTGGTTCGTCGCATGATTGGA TTTTTGAATGTACACAAGCGAGCATCAGTCAGGCGTGCTATAACAGGGCTTGAATTCTTT CATAGGTACCCTCCCTTGCATTCGTTCTTATTTAATGAGCTAAAAATTGCAACTGAGTCA CTTTTGGACGGATCATCTGAACATTTAAGGTCCAGCATGGCTAAAGTTGTGCACCCCAGC TTATGTGCAGTCCTGATTCTCTTATCTAGACTCAAACCTTCTCCAATTGCAAGTGAAGCT GGAGATCCCCAGGATCCTTTCCTGTTCATGCCACTCATCAGGAAATGCTCAGTCCAGAGC AATCTTCGTATCCGTGTTTTCGCATCAAGAGCTCTAACAGGTTTAGTGTCTAATGAAAAG CTTCCACTTGTCCTCCTAAATATTGCCTCTGAGTTACCGGGCGCTGGCGAGCACGTCGAG AATTCTGACGTCTCTCTCTCTTCCATTAGAGTAAATAGCTCTTTTAATTCACTTCATGGG ATGTTATTACAGTTGAACTCTCTTATCGACACAAACTGCAGAGATCTACCTGATGTTTCC AAAAAAGATAATATTCTTGCTGAATTGATACATATTCTTGCTTCACGCTCATGTATTGGG AGTCCTGAGCAATGTCCTTGCCCAATTATCAACAGCTGCTTTTTGAAGGTGCTAGATAGC ATGCTAAGTGTTGCAAGAACATGTCAAACGAGCAAAAATATTGATGTCATTTGGAACCTC CTTTGGCGGCTATCTTCAGAATGTTTCGATTTAGGAGTGGTTTGTGCACCAACATATTTT GATCCAACCATCTCAGAACTTCGGAAGCAAGCTGCAAGTTCATATTTTAATTGTGTTTAC CAAACATCTAAAGAAGCTGCTGAAGAGTATCCGTTAATACCATCAGGAGGCCCTCCTTCT GGTTCAAACTTATCAAAGATATCTGTAAATGAAATTTCTTTCAGCAGATTCCAGGGAAGG CTAATACGTTCGATCTCTGACACTTCATATGAAGTTCGGATTGCAACACTGAAGTGGTTT CTTTTATTTCTCAAGTCACCAGAATATAATGAGATAAAGAGAAGTTGCTTCACCAGCGTT GATCTCCAGACCAGTGTGATGAATCTTTTAACGTTGGACAATAACCATAAATGTTTGAAC TACATTCTGAAGATTATCTACAGCTGGAGTCAGCAGGAGTATCATAATAATGGAGAAGAA TGTGCAGATCCTAAATTTTTTGGTGATATGGGTAGCGAGTCAGTGCTCCAGTTCTGGGAC AAGGTGGTTTCCTTATACAAGGTGACTAGGCATTCAAAGACTCGAGAGATGCTTCTTTGT TGCATGGGGATTTGTATAAAGCAAGTTGCTAGCTCGCTTAGTATTTCAGTTGTAGATTTG CAAAATGTCAAAGCTGGTCAATTTAACCCCCATGATCCATCTGATCCATCTAAATTATCT GTCTTTTACGAGTGCATCAGCTATTATGTAGACCTAATTGAACAACACACTGATGCCTCA GAGCCTGTAAACATGCGTAGGGCGGCTGCGGAGTCTATGATAGCATCTGGTTTGTTGGAT CAAGCCGAAGTTATTGGTCCTTCAGTCTACAATAGCCAAATTCCTGATAGCAATTTCTGC TCCCCGTTCAAGCAAGAAAAGGTGGTTAATATGTATGCCCATAAAATCCTGGATTTATGG TTTTCATGCATTACGCTTCTTGAGGATGAAGATGAGAATCTTAGGAGAAAACTCGCCTTA GATGTCCAGAATTGTCTTACATCTAAAAGATCTGAAAGAAGCTTCGTGACAGGAGTGGTC CCAATCCAAGTAGAGCAAGTGATTGAGAGGAGCTTCAAGCATCTCTCATCAATTTTTGGT CATTGTCTTGACTACCTTGATTTCCTTTGCCGCAGGGTTCTAGGTTCTGCTAACCATGCT TGTTTTATTTCAGAAGGAGATCTTGTCAAACGTGTCTTTGACAAGGAGATTGACAACCAT CATGAAGAAAAACTGTTGATCTGCCAGATATGCTGTTTTCATTTGGAGAAGCTTCCAGCT TCAAGATTTTTGTTAGTTGAACCCTGTAACGTACATGAGGTGAAAGACTTTTTGCAGAAC TGGAGAAGGAGGTTTGCGCAGAAGTTGGTACTATTTGCCAAAGACTACGTTGTTGCACAG GGAGGCGCTGATTGGATTGGTGGGGTTGGTAACCATAAAGATGCCTTCTTACCTCTCTAT GCAAATTTACTTGCCTTTTATGCCTTGTCAAACTGTATTTTTAAGGGGAAACCAGAAGAT AGAAAGTTGATGCTCCCTGAAGTTCAAGAAATTGGTGAGGCCATACAACCGTTCCTTTCC AACCCATTTTTATCTAATTTATTCTCATTGGTGGTTAAGTTACACGACAAGATGATCGGT GAAGGTTCGTGTGATTTTAGCCAAAAGATCATTGATGAGTCAGCTTGGGATTCTTTTGAT CCTTATTTTCTTCTAAGGTGA

Peptide Sequence

PEP ID	XP_016476738.1
PEP Infomation	PREDICTED: thyroid adenoma-associated protein homolog [Nicotiana tabacum]
Sequence	MSAKWRALQHRHRYTYSAVIFPKNFSDAFHQTPSTRFYTELKQFTSLSSTYSQLTHAKNL ASAFAELLLNPNADVSSISTASRFYLEILFLENSQPLHRTLLTVLVKCKNFHNLIRNCFR ELCEEYGEKGKRFCVSRAALSMMSTPKLGYLVEIVEECGVLVSLNVVLGLSEVLEELKNY SRPSPIVMEQCNEALSCMYYLLQRFPLKFVNAAGDNCVFLERILITVLSILRSESFSRDC LVAAGVSFCAALQVCLSHQELGLFIMEGIFNESEIVYDEFEFKDVVNKIPFKGDLIGELS KFLSLSRLCLIRGILTAVSRIVLNIGFLISNDNEESIKMILYDGILPELCNFCENPIDSH FNFHALTVMQICLQQVKTSMLDKNGSREINYDPISEDIGTRLLQIVWNNLEDPLSQTVKQ VHLIFDLFLDIQASLHWVEGSDTFKLFMRKVAFDLLRLGPRCKGRYVPLASLIKRLGART LLSMRPDLLFETIKAYIDDDVCCALTTFLKCFLECLRDEYWSSDGVESGYNKYRGHCLPP LLSGLVSGHSKLRSNLNTYALPVVLELDVDAIFPMLAFIGIGCGGDNGEVFLTELDFRGV TPALEERVAVLVSLFKVSRLLALLEGDIDWSNNSLSSTEDMELNLENRDAVACIKGIEVK VPVKYLVLALTHIDESLRIDAAESLFVNPKTASLPSSLELSLMKVAVPLNMRCCSTAFQM KWTSLFRKFFSRVRTALERQVKQGGWQPLAHKDTRRNFVAKGTGDMFEDRADELFNFMKW LGCFLFFSCYPSAPYERKTMAMELLLIMLNVWSIVLSKEGNIDAVSPQFCLYPYNKGLLL PESTLLLVGSIVDSWDRLRESSFRILLHFPTPLPGIDSQDRVSEAIVWAKKLVCSPRVRE SDAGALTLRLIFRKYVLDLGWVVNASSNDVSPQPLLKLLNGENKACKFAPPAIEYLRSLI DWLDAVVQVGEKDLSEACRGSFVHGALLALRYTFEELDWDSDAVVCSISEMKVVLEKILE LVMRITSLALWVVSADAWYLPDDMEEMDDDALLLEVPHEMAESLSTSDKVENTKVVRDGR QTEQIVMVGCWLAMKEVSLLLGTIIRKVPLPTSDVSESGFQAVHETDLSNMTSGAMLDLK QLEVIGNHFLEVLLKMKHNGAIDKTRAGFTALCNRLLCSNDSRLCKLTESWMEQLMERTV AKGQTVDDLLRRSAGIPAAFIAFFLSEPQGTPKRLLPRALRWLIDVANKSLTDHTETNSF SADACNGFVEAKCPANFSEVAPDIYDAERISKIRDEGVVPTVHAFNVLKVAFNDTNLATD TSGFSAEALIISIRCFSSPHWEIRNSACLAYTALVRRMIGFLNVHKRASVRRAITGLEFF HRYPPLHSFLFNELKIATESLLDGSSEHLRSSMAKVVHPSLCAVLILLSRLKPSPIASEA GDPQDPFLFMPLIRKCSVQSNLRIRVFASRALTGLVSNEKLPLVLLNIASELPGAGEHVE NSDVSLSSIRVNSSFNSLHGMLLQLNSLIDTNCRDLPDVSKKDNILAELIHILASRSCIG SPEQCPCPIINSCFLKVLDSMLSVARTCQTSKNIDVIWNLLWRLSSECFDLGVVCAPTYF DPTISELRKQAASSYFNCVYQTSKEAAEEYPLIPSGGPPSGSNLSKISVNEISFSRFQGR LIRSISDTSYEVRIATLKWFLLFLKSPEYNEIKRSCFTSVDLQTSVMNLLTLDNNHKCLN YILKIIYSWSQQEYHNNGEECADPKFFGDMGSESVLQFWDKVVSLYKVTRHSKTREMLLC CMGICIKQVASSLSISVVDLQNVKAGQFNPHDPSDPSKLSVFYECISYYVDLIEQHTDAS EPVNMRRAAAESMIASGLLDQAEVIGPSVYNSQIPDSNFCSPFKQEKVVNMYAHKILDLW FSCITLLEDEDENLRRKLALDVQNCLTSKRSERSFVTGVVPIQVEQVIERSFKHLSSIFG HCLDYLDFLCRRVLGSANHACFISEGDLVKRVFDKEIDNHHEEKLLICQICCFHLEKLPA SRFLLVEPCNVHEVKDFLQNWRRRFAQKLVLFAKDYVVAQGGADWIGGVGNHKDAFLPLY ANLLAFYALSNCIFKGKPEDRKLMLPEVQEIGEAIQPFLSNPFLSNLFSLVVKLHDKMIG EGSCDFSQKIIDESAWDSFDPYFLLR

Transcript Sequence

Gene sequence data has not been registered.